Au niveau Bachelor, le programme débute avec des cours fondamentaux en management. Afin de mettre en application ces premières connaissances, les étudiants travaillent ensuite, par groupes, sur un projet de recherche appliquée en sciences sociales pendant 4 mois. Parallèlement, ils sont sensibilisés à la démarche entrepreneuriale avec un projet virtuel de création d’entreprise. L’année bachelor se termine par une mission en entreprise de 6 mois à l’étranger, qui permet aux étudiants de s’ouvrir à l’international et de vivre une expérience multi-culturelle en immersion totale. La “mission 2.0” permet enfin aux étudiants de rester en contact, aux 4 coins du monde, par leurs échanges sur un forum en ligne et la création de blogs de voyages.

Le cycle MSc dure 2 ans et démarre après l’année bachelor. Le parcours de l’étudiant devient flexible et s’individualise selon les envies et les projets profesionnels de chacun. C’est l’alternance entre les périodes académiques à EMLYON, les périodes de stages et/ou d'alternance en entreprise (12 mois minimum), les projets associatifs et les échanges dans les universités partenaires de l’école. Le choix des spécialisations se fait en 2 étapes, d’abord avec le parcours fléché puis avec le parcours fléché avancé. Ceci pour garder une cohérence globale du parcours. 

En plus des parcours personnalisés, il est possible de choisir des parcours adaptés aux créateurs d’entreprise (parcours startup) et aux membres d’associations (parcours associatif). Un autre parcours permet aux étudiants de partir étudier sur le campus chinois d’EMLYON à Shanghai, c’est le parcours Asie. Enfin des parcours croisés permettent d’opter pour un double diplôme avec par exemple Centrale Lyon, l’IEP de Lyon, l’Ecole des Mines de Saint-Etienne… sans oublier les doubles diplômes avec les universités partenaires à l’international.